Zestaw do genotypowania myszy
Nr kat.: HCR2021A
Ten produkt to zestaw przeznaczony do szybkiej identyfikacji genotypów myszy, obejmujący ekstrakcję surowego DNA i system amplifikacji PCR.Produkt może być stosowany do amplifikacji PCR bezpośrednio z mysiego ogona, ucha, palca u nogi i innych tkanek po prostym rozszczepieniu za pomocą buforu lizującego i proteinazy k.Bez trawienia przez noc, ekstrakcji fenolem i chloroformem czy oczyszczania na kolumnie, co jest proste i skraca czas eksperymentów.Produkt nadaje się do amplifikacji fragmentów docelowych do 2 kb i multipleksowych reakcji PCR z maksymalnie 3 parami starterów.Mieszanka 2×Mouse Tissue Direct PCR Mix zawiera genetycznie modyfikowaną polimerazę DNA, Mg2+, dNTP i zoptymalizowany układ buforów zapewniający wysoką wydajność amplifikacji i tolerancję na inhibitory, dzięki czemu reakcje PCR można przeprowadzić poprzez dodanie matrycy i starterów oraz ponowne uwodnienie produktu do 1×.Produkt PCR amplifikowany tym produktem ma wyraźną zasadę „A” na końcu 3′ i po oczyszczeniu może być użyty bezpośrednio do klonowania TA.
składniki
Część | Rozmiar |
2×Mieszanka do bezpośredniego PCR tkanek mysich | 5×1,0 ml |
Bufor do lizy | 2×20 ml |
Proteinaza K | 800µl |
Warunki przechowywania
Produkty należy przechowywać w temperaturze -25 ~ -15 ℃ przez 2 lata.Po rozmrożeniu bufor lizujący można przechowywać w temperaturze 2 ~ 8 ℃ do krótkotrwałego wielokrotnego użycia i dobrze wymieszać podczas użycia.
Aplikacja
Ten produkt nadaje się do analizy nokautu myszy, wykrywania transgenicznego, genotypowania i tak dalej.
Cechy
1.Prosta obsługa: nie ma potrzeby ekstrakcji genomowego DNA;
2.Szerokie zastosowanie: odpowiednie do bezpośredniej amplifikacji różnych tkanek myszy.
Instrukcje
1.Uwalnianie genomowego DNA
1) Przygotowanie lizatu
Lizat tkankowy przygotowuje się w zależności od liczby próbek myszy przeznaczonych do lizy (lizat tkankowy należy przygotować na miejscu zgodnie z dawką i dokładnie wymieszać przed użyciem), a proporcja odczynników wymaganych do pojedynczej próbki jest następująca:
składniki | Objętość (µL) |
Proteinaza K | 4 |
Bufor do lizy | 200 |
2) Przygotowanie próbki i liza
Zalecane użycie tkanki
TypTkanka | Zalecana objętość |
Ogon myszy | 1-3 mm |
Ucho myszy | 2-5 mm |
Palec myszy | 1-2 sztuki |
Pobrać odpowiednią ilość próbek tkanek myszy do czystych probówek wirówkowych, dodać 200 µl świeżego lizatu tkanek do każdej probówki wirówkowej, wymieszać i wstrząsnąć, następnie inkubować w temperaturze 55°C przez 30 minut, a następnie ogrzewać w temperaturze 98°C przez 3 minuty.
3) Wirowanie
Dobrze wstrząśnij lizatem i wiruj przy 12 000 obr./min przez 5 minut.Supernatant można zastosować jako matrycę do amplifikacji PCR.Jeśli szablon jest potrzebny do przechowywania, przenieś supernatant do innej sterylnej probówki wirówkowej i przechowuj w temperaturze -20°C przez 2 tygodnie.
2.Amplifikacja PCR
Wyjąć 2×Mouse Tissue Direct PCR Mix z -20°C i rozmrozić na lodzie, wymieszać do góry nogami i przygotować układ reakcji PCR zgodnie z poniższą tabelą (działać na lodzie):
składniki | 25µlSystem | 50µlSystem | Końcowe stężenie |
2×Mieszanka do bezpośredniego PCR tkanek mysich | 12,5 µl | 25µl | 1× |
Podkład 1 (10μM) | 1,0 µl | 2,0 µl | 0,4μM |
Podkład 2 (10μM) | 1,0 µl | 2,0 µl | 0,4μM |
Produkt do rozszczepianiaa | Jak wymagają | Jak wymagają |
|
ddH2O | Do 25μL | Do 50μl |
|
Notatka:
a) Dodana ilość nie powinna przekraczać 1/10 układu, a jeśli zostanie dodana zbyt duża ilość, amplifikacja PCR może zostać zahamowana.
Zalecane warunki PCR
Krok cyklu | Temp. | Czas | Cykle |
Początkowa denaturacja | 94℃ | 5 minut | 1 |
Denaturacja | 94℃ | 30 sek | 35-40 |
Wyżarzaniea | Tm + 3 ~ 5 ℃ | 30 sek | |
Rozszerzenie | 72 ℃ | 30 sek./kb | |
Ostateczne przedłużenie | 72 ℃ | 5 minut | 1 |
- | 4℃ | Trzymać | - |
Notatka:
a) Temperatura wyżarzania: W odniesieniu do wartości Tm podkładu zaleca się ustawienie temperatury wyżarzania na niższą wartość Tm podkładu +3~5℃.
Typowe problemy i rozwiązania
1.Brak ukierunkowanych pasków
1) Nadmiar produktu lizy.Wybierz najbardziej odpowiednią ilość szablonu, zwykle nie większą niż 1/10 układu;
2) Zbyt duża wielkość próby.Rozcieńczyć lizat 10 razy, a następnie amplifikować lub zmniejszyć wielkość próbki i przeprowadzić ponowną lizę;
3) Próbki tkanek nie są świeże.Zaleca się stosowanie świeżych próbek tkanek;
4) Zła jakość podkładu.Użyj genomowego DNA do amplifikacji, aby zweryfikować jakość startera i zoptymalizować projekt startera.
2.Amplifikacja niespecyficzna
1) Temperatura wyżarzania jest zbyt niska, a liczba cykli jest zbyt wysoka.Zwiększ temperaturę wyżarzania i zmniejsz liczbę cykli;
2) Stężenie szablonu jest zbyt wysokie.Po amplifikacji zmniejszyć ilość szablonu lub rozcieńczyć szablon 10 razy;
3) Słaba specyficzność startera.Zoptymalizuj projekt podkładu.
Notatki
1.Aby uniknąć zanieczyszczenia krzyżowego próbek, należy przygotować wiele narzędzi do pobierania próbek, a powierzchnię narzędzi można oczyścić 2% roztworem podchlorynu sodu lub środkiem czyszczącym na bazie kwasu nukleinowego po każdym pobraniu próbki, jeśli wymagane jest wielokrotne użycie.
2.Zaleca się stosowanie świeżych tkanek myszy, a objętość próbki nie powinna być zbyt duża, aby uniknąć wpływu na wyniki amplifikacji.
3.Bufor do lizy powinien unikać częstego zamrażania i rozmrażania i można go przechowywać w temperaturze 2 ~ 8 ℃ do krótkotrwałego wielokrotnego użycia.W przypadku przechowywania w niskiej temperaturze może nastąpić wytrącenie osadu, który przed użyciem musi zostać całkowicie rozpuszczony.
4.Mieszankę PCR należy unikać częstego zamrażania i rozmrażania i można ją przechowywać w temperaturze 4°C w celu krótkotrwałego wielokrotnego użycia.
5.Ten produkt jest przeznaczony wyłącznie do naukowych badań eksperymentalnych i nie powinien być używany w diagnostyce klinicznej ani leczeniu.